Unii au speculat că submarinul sovietic K-129 a fost scufundat de un submarin american, iar scufundarea lui Scorpion a fost făcută ca răspuns la aceasta. Alţii susţin că nava americană avea unele defecţiuni, care din motive de cost şi de timp, nu au fost rezolvate. Deşi există o sumedenie de teorii, dovezile pentru acestea lipsesc, scufundarea submarinului rămânând un mister şi astăzi, după mai bine de 50 de ani de la eveniment.